Troed Hjalmarsson har misslyckats i envigen mot Johans väpnare, och vem som bär skulden för hans förgiftning förblir oklart. Ingrid och Esmeralda söker efter den kloka gumman Fridälv, som försvunnit spårlöst, i hopp om att hennes kunskaper kan hjälpa dem med att lista ut vem som är den skyldige. Troed får dock snart andra bekym mer när bröderna till kungens rådgivare Roar Sigurdsson kommer till borgen för att utreda hans mord, fast beslutna att se den skyldige avrättad. Väpnaren Erik gör allt han kan för att leda bort misstankarna från den verkliga dråparen, men han kan inte skydda Eva mot Roars hemsökelser. I en annan del av riket, lämnar nunnan Ulrika sitt trygga klos ter för att bege sig till Uppsala på ett uppdrag.
I Troeds kamp att göra det rätta, ställs han öga mot öga med sitt förflutna och sina tidigare misslyckanden, och han får lära sig vad sann styrka och mod innebär.
Kors skär djupt är den tredje delen i serien Riddaren Troed.